Agarose -Gel ist die gängigste Methode zur Visualisierung von DNA. Verschiedene Prozentsätze von Agarose kann in Abhängigkeit von der Größe des zu visualisierenden DNA verwendet werden. Ein geringer Prozentsatz von Agarose, wie 0,7 Prozent hat die Auflösung auf große DNA-Fragmente zu visualisieren. Ein höherer Prozentsatz , wie beispielsweise 2 Prozent , wird oft verwendet, um kleine DNA-Fragmente zu visualisieren. Um DNA sichtbar , Ethidiumbromid wird häufig verwendet, da es interkaliert mit DNA und fluoresziert im UV-Licht .
Polyacrylamid
Polyacrylamid- Gele werden zur Trennung von DNA-Fragmenten so klein wie verwendet 10 Basenpaare bis zu 1 kb. Diese Gele haben eine kleine Trennbereich, aber mit einer hohen Auflösung . Sie sind jedoch auch komplizierter herzustellen . Es ist auch möglich , große Mengen an DNA , ohne die Auflösung zu laden. Wie bei Agarose, Ethidiumbromid wird oft verwendet, um die DNA-Fragmente sichtbar zu machen, aber Polyacrylamid können die Fluoreszenz löschen , so dass es schwierig ist, kleine Mengen an DNA zu visualisieren.
Pulse - Field Bags
Diese Form der Elektrophorese verwendet, um große DNA-Moleküle zu trennen und wird oft für die Genotypisierung verwendet . Große DNA-Fragmente wandern in einem ähnlichen Ausmaß . Es kann schwierig sein , also auf verschiedenen Bändern zu lösen. Pulsfeld - Elektrophorese wechselt das elektrische Feld . Dies ermöglicht eine bessere Trennung und Auflösung der DNA.
Capillary
Kapillarelektrophorese ist eine schnelle und sensitive Methode zur Trennung von DNA. Kleine Mengen von DNA gelöst werden können . Die DNA kann mit Fluoreszenzmarkierung oder mit UV-Licht sichtbar gemacht werden.
Denaturierung
Die Trennung der DNA kann durch seine Struktur kompliziert sein. Es ist möglich, unter Verwendung von Harnstoff und Formamid , die Struktur durch Absenken des Schmelzpunktes der DNA zu zerstören. Dies kann in beiden Agarose und Polyacrylamid- Gele verwendet werden.
Überlegungen
Die Elektrophorese -Methode ausgewählt wird von der Größe der DNA-Fragmente zu trennen abhängen. Wie die DNA wird nach der Trennung verwendet werden, bestimmen auch die letzte Methode.
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