Kohlendioxid
Kohlendioxid ist das erste Endprodukt der aeroben Atmung. Es wird freigesetzt wenn Nährstoffmoleküle in der zweiten Phase der aeroben Atmung in die Kraftwerke von Zellen die Mitochondrien gelangen. Die Struktur löst sich auf und einige Moleküle bewegen sich weiter auf dem aeroben Atmungsweg. Ein überschüssiges Kohlenstoffatom verbindet 2 Sauerstoffatome zu Kohlendioxid das als Abfall betrachtet und durch Ausatmen ausgestoßen wird. In der dritten Stufe wird auch Kohlendioxid freigesetzt. Insgesamt sechs Moleküle Kohlendioxid sind Abfallprodukte.
Wasser
Sauerstoff wird meist indirekt während der gesamten aeroben Atmung verwendet. Drei wichtige Schritte können nicht ohne Sauerstoff als Helfer durchgeführt werden. Nur im allerletzten Schritt des Prozesses wird Sauerstoff direkt verwendet. Der allerletzte Schritt verbindet Wasserstoff- und Sauerstoffatome. Sechs Wassermoleküle entstehen als Endprodukt der aeroben Atmung.
ATP
Das Ziel der aeroben Atmung ist es Energie zu erzeugen und ATP fängt Energie in den Bindungen zwischen seinen einzelnen Molekülen ein. Die aerobe Atmung liefert ATP über die 4 Stadien. In der ersten Stufe werden zwei ATPs gebildet in der dritten Stufe zwei und in der letzten Stufe 32 ATPs. Insgesamt gibt es 36 ATP-Moleküle in der gesamten aeroben Atmung die im gesamten Körper zur Energiegewinnung genutzt werden
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