Benzalkoniumchlorid ist eine quartäre Ammoniumverbindung, das heißt, es enthält ein Stickstoffatom mit vier daran gebundenen Alkylgruppen. Es ist ein kationisches Tensid, das heißt, es hat eine positive Ladung. Benzalkoniumchlorid ist eine schwache Base mit einem pKa-Wert von etwa 12. Das bedeutet, dass es ein Proton an eine stärkere Base abgeben kann, aber kein Proton von einer schwächeren Säure aufnehmen kann.
