Jodtinktur wird im Allgemeinen nicht zur Reinigung chirurgischer Instrumente verwendet, da sie nicht als Sterilisationsmittel gilt. Obwohl Jod einige antimikrobielle Eigenschaften hat, ist es nicht gegen alle Arten von Mikroorganismen wirksam und bietet nicht den für chirurgische Instrumente erforderlichen Sterilisationsgrad.
Zur Sterilisation chirurgischer Instrumente wird typischerweise eine robustere Methode wie Dampfsterilisation oder chemische Sterilisation verwendet.