Bei der mikroskopischen Untersuchung hingegen werden Mikroskope eingesetzt, um Strukturen sichtbar zu machen und zu untersuchen, die mit bloßem Auge nicht ohne weiteres sichtbar sind. Dies ermöglicht eine detailliertere Analyse von Zellen, Geweben und Mikroorganismen. Bei der mikroskopischen Untersuchung können verschiedene Techniken zum Einsatz kommen, beispielsweise Lichtmikroskopie (unter Verwendung von sichtbarem Licht), Elektronenmikroskopie (unter Verwendung von Elektronenstrahlen) oder Fluoreszenzmikroskopie (unter Ausnutzung fluoreszierender Eigenschaften).
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass der Hauptunterschied zwischen der makroskopischen und der mikroskopischen Untersuchung im Umfang und Detaillierungsgrad liegt. Die grobe Untersuchung konzentriert sich auf größere anatomische Merkmale, während die mikroskopische Untersuchung winzige Strukturen auf zellulärer und subzellulärer Ebene untersucht. Beide spielen eine entscheidende Rolle in der Pathologie und helfen bei der Diagnose und dem Verständnis der zugrunde liegenden Mechanismen von Krankheiten.
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