Das im Magen vorhandene Enzym, das die Verdauung von Proteinen unterstützt, heißt Pepsin. Pepsin wird in Form von Pepsinogen ausgeschieden, das inaktiv ist, und dann im sauren Milieu des Magens durch Salzsäure aktiviert. Pepsin wirkt am besten unter sauren Bedingungen und zerlegt Proteine in kleinere Peptidfragmente und bereitet sie so auf die weitere Verdauung durch andere Enzyme im Dünndarm vor.