Die Bronchien sind mit pseudostratifiziertem Flimmerepithel ausgekleidet. Dieser Epitheltyp besteht aus mehreren Zellschichten, wobei die Flimmerzellen die oberflächlichste Schicht bilden. Die Flimmerzellen haben kleine Härchen, sogenannte Flimmerhärchen, die koordiniert schlagen, um Schleim und Fremdkörper in den Atemwegen zu befördern. Weitere in den Bronchien vorkommende Zellen sind Becherzellen, die Schleim produzieren, und Basalzellen, bei denen es sich um Stammzellen handelt, die sich in andere Zelltypen differenzieren können.