ABPA folgt typischerweise einem chronischen, rezidivierenden Verlauf mit abwechselnden Perioden von Exazerbationen und Remissionen. Die Prognose für Patienten mit ABPA ist im Allgemeinen günstig. Die Mehrzahl der Patienten spricht gut auf die Behandlung mit systemischen Kortikosteroiden an und kann eine langfristige Remission erreichen. Bei einigen Patienten kann es jedoch zu wiederkehrenden Exazerbationen oder zu chronischen Lungenschäden kommen, die mit der Zeit zu einer Verschlechterung der Lungenfunktion führen. In seltenen Fällen kann ABPA zu einer Lungenerkrankung im Endstadium und Atemversagen führen, was eine Lungentransplantation erforderlich macht.
