Der Ursprung der Malaria ist nicht ganz klar, man geht jedoch davon aus, dass sie ihren Ursprung in Afrika südlich der Sahara hat. Hinweise auf Malariaparasiten wurden in versteinerten Mücken aus dem Miozän vor etwa 20 Millionen Jahren gefunden. Diese Fossilien wurden in der Dominikanischen Republik entdeckt und deuten darauf hin, dass es auf dem amerikanischen Kontinent vor der Ankunft des Menschen möglicherweise Malaria gab. Der genaue geografische Ursprung der Malaria bleibt jedoch ungewiss.
