Der Geruch von Fäkalien ist auf das Vorhandensein flüchtiger organischer Verbindungen (VOCs) zurückzuführen, die von anaeroben Bakterien produziert werden, die die Nahrung, die wir zu uns nehmen, abbauen. Zu diesen VOCs gehören Schwefelwasserstoff, Methan und Ammoniak, die alle einen starken und unangenehmen Geruch haben. Die Zusammensetzung der VOCs im Kot kann je nach Ernährung, Gesundheitszustand und Medikamenten des Einzelnen variieren. Der Kot enthält außerdem eine Vielzahl anderer Verbindungen, wie z. B. Gallenfarbstoffe, Fette und Proteine, die zu seinem Gesamtgeruch beitragen.