Der Große Brand von London hatte tatsächlich negative Auswirkungen auf die Pest. Das Feuer zerstörte viele der infizierten Gebäude und tötete viele der infizierten Menschen, schuf aber auch ideale Bedingungen für die Ausbreitung der Pest. Die obdachlosen Überlebenden des Brandes mussten in überfüllten und unhygienischen Verhältnissen leben, was sie anfälliger für die Krankheit machte. Darüber hinaus beeinträchtigte das Feuer die Infrastruktur der Stadt und erschwerte die Verteilung von Nahrungsmitteln und Wasser sowie die Kontrolle der Ausbreitung der Krankheit. Infolgedessen breitete sich die Pest in London noch mehrere Monate nach dem Brand weiter aus.