Das Pfeiffer-Syndrom ist eine seltene genetische Störung. Die genaue Prävalenz ist nicht bekannt, es wird jedoch geschätzt, dass sie bei etwa 1 von 100.000 bis 1 von 150.000 Lebendgeburten auftritt. Damit gibt es weltweit nur wenige Tausend Menschen mit dem Pfeiffer-Syndrom.