Die überwiegende Mehrheit der Fälle einer viralen Myokarditis heilt vollständig aus und die normale Herzfunktion wird wiederhergestellt. Die Prognose ist im Allgemeinen gut und die meisten Menschen erholen sich vollständig. In seltenen Fällen kann eine Myokarditis jedoch zu schwerwiegenden Komplikationen wie Herzversagen, Herzrhythmusstörungen und plötzlichem Herztod führen. Die Erholungszeit variiert je nach Schwere der Infektion und dem allgemeinen Gesundheitszustand des Einzelnen. Eine leichte Myokarditis verschwindet in der Regel innerhalb weniger Wochen, in schwereren Fällen kann es jedoch mehrere Monate oder sogar ein Jahr dauern, bis sie vollständig abgeheilt ist.