Die geschätzte Prävalenz des Fragile-X-Syndroms beträgt weltweit 1 von 4.000 Männern und 1 von 8.000 Frauen. Das bedeutet, dass es weltweit etwa 1.250.000 Menschen mit dem Fragile-X-Syndrom gibt, wobei etwa 312.500 dieser Personen weiblich und 937.500 männlich sind. Die Prävalenz des Fragile-X-Syndroms ist in den Vereinigten Staaten am höchsten, wo schätzungsweise 1 von 2.500 Männern und 1 von 5.000 Frauen davon betroffen sind.