Synapsen sind Verbindungen zwischen zwei Neuronen, an denen Signale von einem Neuron zum anderen übertragen werden. Im Rückenmark liegen Synapsen in der grauen Substanz, die sich in der Mitte des Rückenmarks befindet. Die graue Substanz enthält die Zellkörper von Neuronen sowie Dendriten und Axone, die Verlängerungen von Neuronen, die Signale übertragen.
Die weiße Substanz, die sich an der Außenseite des Rückenmarks befindet, enthält Axonbündel, die Signale entlang des Rückenmarks auf- und abwärts übertragen. Synapsen kommen in der weißen Substanz nicht vor.
Die spezifische Lage der Synapsen im Rückenmark hängt von der Art des beteiligten Neurons ab. Synapsen zwischen sensorischen Neuronen und Motoneuronen finden beispielsweise im Vorderhorn des Rückenmarks statt, während Synapsen zwischen Interneuronen im Hinterhorn vorkommen.
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