Die Proteinverdauung endet im Dünndarm. Proteine werden im Magen teilweise durch das Enzym Pepsin verdaut und im Dünndarm durch verschiedene Enzyme wie Trypsin, Chymotrypsin und Elastase weiter in Aminosäuren zerlegt. Diese Aminosäuren werden dann von den Zellen im Dünndarm aufgenommen.