Magensäure greift den Darm nicht an. Der Magen ist ein Muskelorgan, das die Nahrung umwälzt und sie mit der Magensäure vermischt, um sie aufzuspalten. Die Säuren im Magen sind Salzsäure und Pepsin. Salzsäure tötet Bakterien ab und hilft beim Abbau von Proteinen. Pepsin ist ein Enzym, das beim Abbau von Proteinen hilft. Der Darm ist mit einer Schleimschicht ausgekleidet, die ihn vor der Magensäure schützt.