Magensaft enthält ein Proteaseenzym namens Pepsin, das für die Verdauung von Proteinen im Magen verantwortlich ist. Pepsin ist im sauren Milieu des Magens am aktivsten, mit einem optimalen pH-Wert von etwa 1,5 bis 2,5. Es zerlegt Proteine in kleinere Peptidfragmente und leitet so den Prozess der Proteinverdauung ein.