Schwämme sind Filterfresser und nutzen ihre Choanozyten, um Nahrungspartikel aus dem Wasser einzufangen und zu verdauen. Die Choanozyten erzeugen einen Wasserstrom durch den Körper des Schwamms, indem sie ihre Flagellen schlagen, bei denen es sich um peitschenartige Gebilde handelt, die aus dem Kragen der Mikrovilli herausragen. Dieser Wasserstrom transportiert Nahrungspartikel wie Plankton und Bakterien in den Körper des Schwamms, wo sie von den Choanozyten eingefangen werden.
Die Choanozyten verschlingen dann die Nahrungspartikel durch Phagozytose, bei dem feste Partikel von einer Zelle verschlungen werden. Die Nahrungspartikel werden dann in den Lysosomen der Choanozyten verdaut, bei denen es sich um Organellen handelt, die Verdauungsenzyme enthalten. Die Nährstoffe aus den verdauten Nahrungspartikeln werden dann an den Schwammkörper abgegeben und vom Schwamm zum Wachstum und zur Reparatur seiner Zellen verwendet.
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