Die dritte Stufe der Verdauung ist die Resorption, die beginnt, wenn die Nahrung in den Dünndarm gelangt. Der Dünndarm ist ein langer, spiralförmiger Schlauch, der für den Großteil der Nährstoffaufnahme aus der Nahrung verantwortlich ist. Die Wände des Dünndarms sind mit winzigen Zotten ausgekleidet, bei denen es sich um fingerartige Vorsprünge handelt, die die Oberfläche des Darms vergrößern und bei der Aufnahme von Nährstoffen helfen. Die Zotten sind mit Mikrovilli bedeckt, bei denen es sich um noch kleinere Vorsprünge handelt, die die Oberfläche des Darms weiter vergrößern.
Die Aufnahme von Nährstoffen aus der Nahrung erfolgt durch einen Prozess, der als aktiver Transport bezeichnet wird. Für den aktiven Transport ist Energie in Form von ATP erforderlich, um Nährstoffe aus dem Dünndarmlumen in den Blutkreislauf zu transportieren. Zu den Nährstoffen, die im Dünndarm absorbiert werden, gehören Kohlenhydrate, Proteine, Fette, Vitamine und Mineralien.