Wenn B-Lymphozyten im Verdauungstrakt verbleiben, können sie sich in Plasmazellen differenzieren, die Antikörper produzieren. Diese Antikörper können sich an Antigene im Verdauungstrakt binden, beispielsweise solche, die sich auf Bakterien oder Nahrungspartikeln befinden. Diese Bindung kann zur Aktivierung des Immunsystems führen, was zu Entzündungen und Schäden im Verdauungstrakt führen kann. Dieser Zustand wird als entzündliche Darmerkrankung (IBD) bezeichnet.