Der Verdauungssaft, der nur auf Proteine wirkt, ist Trypsin. Trypsin wird von der Bauchspeicheldrüse produziert und in den Dünndarm abgegeben. Es handelt sich um eine Endopeptidase, das heißt, sie spaltet Peptidbindungen im Inneren von Proteinmolekülen. Trypsin wirkt auf Proteine, die teilweise von anderen Verdauungsenzymen, wie zum Beispiel Pepsin aus dem Magen, abgebaut wurden, und wandelt sie in kleinere Peptide und Aminosäuren um.