Als anaerobe Vergärung bezeichnet man die Vergärung unter Ausschluss von Sauerstoff. Dieser Prozess findet bei bestimmten Mikroorganismen wie Bakterien und Archaeen statt, die organische Stoffe ohne die Anwesenheit von Sauerstoff abbauen können. Die anaerobe Vergärung wird häufig in Kläranlagen und Biogasproduktionsanlagen eingesetzt, um organische Abfälle in Biogas umzuwandeln, eine Mischung aus Methan und Kohlendioxid, die als erneuerbare Energiequelle genutzt werden kann.