Pepsin ist ein Enzym, das von den Hauptzellen des Magens produziert wird und im Magen aktiv ist. Es funktioniert am besten im sauren Milieu des Magens, das einen pH-Wert von etwa 1,5 bis 2,0 hat. Pepsin zerlegt Proteine in kleinere Peptide und ist besonders wirksam bei der Verdauung von Kollagen, einem Protein, das im Bindegewebe vorkommt. Die von den Belegzellen des Magens produzierte Salzsäure trägt dazu bei, das saure Milieu zu schaffen, das für die effektive Wirkung von Pepsin notwendig ist. Pepsin ist bei höheren pH-Werten, wie sie beispielsweise im Dünndarm vorkommen, inaktiv und seine Aktivität ist daher auf den Magen beschränkt.