Hämangiome können in inneren Organen auftreten, sind jedoch weitaus seltener als kutane (Haut-)Hämangiome. Sie können Leber, Milz, Lunge, Gehirn und andere Organe betreffen. Interne Hämangiome können je nach Lokalisation und Größe schwerwiegende klinische Manifestationen hervorrufen. Sie können je nach Lage und Größe der Läsion zu Funktionsstörungen, Blutungen, Thrombosen, Kompression benachbarter Strukturen und anderen Symptomen führen.